Blauwalg is een jaarlijks terugkerend probleem, ook op De Plas van Poot. Blauwalgen zijn geen algen maar bacteriën. De meeste soorten zijn blauwgroen van kleur. Overlast door blauwalgen ontstaat meestal bij warm weer in voedselrijk water. De blauwalgen groeien namelijk optimaal bij een temperatuur tussen 20 en 30 ºC, bij nog hogere temperaturen groeien ze harder. Blauwalgen komen vooral voor in zoet stilstaand water zoals vijvers maar ook in zwemplassen.
Blauwalg veroorzaakt in De Plas van Poot met name sterfte bij diverse eenden soorten en nijlganzen.
